Ömer Keskin Yüksek lisans döneminde "İbni Teymiyye' de şirk kavramı" adlı tez üzerinde çalıştı. Aynı zamanda Yüksek lisansla beraber Diyanet İşleri başkanlığı İstanbul Haseki eğitim merkezi 3.Dönem Yüksek Lisans ve Doktora bölümüne de kayıt yaptırdı. Ömer Keskin Burada 30 Ay içinde Arapça ve İslam'ın temel kaynakları üzerine ihtisas yaptı. Aynı zamanda yüksek Lisans ve 30 Aylık Eğitim merkezini beraber yürüttü. 13 Mayıs 1993 tarihinde söz konusu eğitim merkezini bölüm ikincisi olarak bitirmiştir. Ayrıca 1993 yılında Trabzon-Köprübaşı İlçe Müftülüğüne atanmıştır. 5 yıl burada çalıştı.
Ömer Keskin 1998 Yılında Yozgat İli Sarıkaya İlçesi Müftülüğünde göreve başlamıştır. Burada da yaklaşık 9,5 yıl başarılı bir hizmet yürüttü. Bu hizmetleri Türkiye Diyanet Vakfı genel merkezince de iki kez teşekkür belgesi ile ödüllendirildi. 2007 yılında ise Amasya ili Suluova ilçesi müftülüğüne atanmıştır. Dört yıl bu görevi yürüttükten sonra 2011-2014 yıllarında Çaycuma İlçe Müftülüğü, 2014-2019 Şehitkamil İlçe Müftülüğü görevini yaptı. 2019 Haziran ayında da 30814 numaralı karar ile Van İl Müftülüğü görevine atanmıştır. Son olarak Bartın İl Müftülüğüne atanmıştır. Ömer Keskin Orta derecede İngilizce ve iyi derecede Arapça bilen Müftü Keskin, evli ve üç çocuk babasıdır.