1959 yılında Ağrı'nın Patnos ilçesinde doğdu. 1974 yılına kadar Patnos, Muş ve Bitlis'in çeşitli köylerinde tanınan alimlerinden İslami ilimler, Arapça ve Farsça eğitimi aldı. Ayrıca 1974 yılında dışarıdan bitirme sınavlarına girip ilkokul diploması aldı. Mehmet Hanifi Alır, Van'da orta eğitime başladı. Alır, İstanbul Teknik Üniversitesi İnşaat Fakültesi'nden mezun olduktan sonra bir süre inşaat mühendisi olarak çalıştı. 1994 yılından beri kendi firmasında serbest olarak çalıştı. 2007 Türkiye Genel seçimleri'nde Adalet ve Kalkınma Partisi Ağrı milletvekili seçilmiştir. 2007-2011 arası Ak Parti Ağrı Milletvekilliği yaptı. Bu dönemde Hindistan Dostluk Grubu Başkanlığı ve aynı zamanda Uluslar Arası Parlementerler Birliği Türkiye Temsilciliği yaptı. Çeşitli Arapça kanallarda tartışma programlarına katıldı. Son olarak Arapça, İngilizce, Çekçe ve Farsça bilen Alır, evli ve iki çocuk babasıdır.