Tuğgeneral Eyüp Subaşı daha sonra sırasıyla Siirt Eruh, Şırnak Çakırsöğüt, Ankara Bala, Batman Sason, Muğla Merkez, Şanlıurfa Siverek, Diyarbakır Lice`de Tim, Bölük ve İlçe Jandarma Komutanlığı görevlerinde bulunmuştur. Daha sonra Jandarma Genel Komutanlığı Karargahında Şube Müdürlüğü ve Daire Başkanlığı yapmıştır. Cumhurbaşkanlığının 23.08.2021 tarihli ve 2021/421 sayılı Kararnamesi ile Tuğgeneralliğe terfi etmiştir. 23.08.2021-16.08.2022 tarihleri arasında Jandarma İHA Komutanı olarak görev yapmıştır. Son olarak Cumhurbaşkanlığının 12 Ağustos 2022 tarihli ve 2022/407 sayılı onayı ile Bitlis İl Jandarma Komutanı olarak atanmıştır.